核磁共振检查常被用于颈椎病的诊断。而常用序列为平扫。包括T2WI,用来观察颈椎的矢状面、横状面，T1WI，主要观察矢状面。液体敏感序列包括FS/ IDEAL/STIR。以及梯度回波序列及冠状面序列。

轴位层面的梯度回波序列可以清楚的看到椎体及椎间盘、椎间孔、脊髓内灰白质的信号，是否异常及神经根受压情况。

因脊柱疾病检查出现高信号时常受脂肪等组织的影响，所以在核磁共振检查中使用抑脂序列可以更为清楚的进行观察。

核磁共振检查还可以用于神经成像（MRM），可直接显示神经根，可根据需要进行多方面重建。用于观察神经根走行病变神经根受压或移位的情况。