FC(甲醛甲酚)

具有较强的除臭，杀菌作用，在20世纪初备受欢迎，但因其具有致畸，致癌，致敏性，现在临床已经弃用。

CP（樟脑对氯酚CMCP）

具有较强的杀菌作用，但刺激性大，特别是根尖周组织，21世纪由于Ca(OH)2的运用基本已经被淘汰。

木榴油

具有杀菌，除臭，防腐，镇痛，消毒的作用，作用仅次于FC，但因为具有特异臭味为患者所不接受目前已不应用于临床。

Ca(OH）2糊剂

具有牙本质渗透性，抗菌性，杀菌性，诱导牙齿硬组织形成的能力，目前建议作为常规根管内消毒药物使用。常规根管内消毒封药时间建议1周以上时间，严重根尖周病变者，封药时间原则上直至无渗出物为止。

VITAPEX（碘仿氢氧化钙糊剂）

类似药物Metapex，具有杀菌，抑菌，诱导根尖孔形成，和促进根尖周病变愈合的作用。目前其临床文献数据较少。

其他

如抗生素累，激素类，氯己定凝胶等，亦有相关文献介绍作为根管内消毒药物。